Articles

Found 2 Documents
Search

APLIKASI ANALISA MORFOLOGI DAN DNA BARCODING PADA PENENTUAN JENIS KEPITING PORCELAIN (PISIDIA Sp.) YANG BERASAL DARI PULAU TUNDA, BANTEN Triandiza, Teddy; Maddupa, Hawis
JURNAL SUMBERDAYA AKUATIK INDOPASIFIK Volume 2, Number 2, November 2018
Publisher : Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Papua

Show Abstract | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (758.553 KB)

Abstract

Fenomena cryptic species (hampir mirip) pada biota akuatik sering ditemukan pada ekosistem yang mengalami perubahan, seperti karang mati.  Karang mati menjadi habitat yang masih dapat dimanfaatkan biota laut salah satunya kepiting decapoda familia Porcellanidae.. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan memastikan jenis dari kepiting porcelain yang berasal dari Pulau Tunda, Banten dengan mengaplikasi analisa mororfologi dan teknik DNA barcoding. Hasil analisa morfologi menunjukkan bahwa sampel decapoda yang di analisis merupakan kepiting dari genus Pisidia familia Porcellanidae dengan karekteristik morfologi rasio ukuran karapas lebih panjang dari pada lebar, antena panjang dan bisa digerakkan, bagian rostrum anterior bergerigi, capit agak pipih dan ukuran lengan tidak sama besar. Sedangkan berdasarkan analisis barcode secara molekuler menggunakan COI, maka didapatkan hasil Anomura sp. dengan persentase kesamaan identifikasi 94%. Perbedaan tersebut di duga karena pada genbank belum terdapat data genetik yang sesuai.
Molecular Characteristics of Cytochrome B for Mackerel Barcoding Maulid, Deden Yusman; Nurilmala, Mala; Nurjanah, Nurjanah; Maddupa, Hawis
Jurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia Vol 19, No 1 (2016): Jurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia
Publisher : Department of Aquatic Product Technology

Show Abstract | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (1957.716 KB)

Abstract

Cytochrome b (cyt b) is one of the genes in mitochondrial DNA that is often used as a molecularmarker to identify species through DNA Barcoding. The aim of the present study was to investigate thebioinformatic of cyt b that isolated from mackerel fish. PCR amplification showed the length of DNA cytb from king mackerel was 803 bp within purine 312 bp and pyrimidine 491 bp while Korean mackerel 791bp within purine 316 bp and pyrimidine 475 bp. Phylogenetic analysis showed all sample join in mackerelgroups (Scomberomorus commerson and Scomberomorus koreanus). The Isoelectric point value of cyt b fromking mackerel is 6.38 and molecular weight is 29826.23; Korean mackerel are 8.67 and molecular weight is29372.77. Hydrophaty plot showed cyt b of mackerel more hydrophobic. Based on 3D modelling both ofthem have eight different sections showing by different colors.Keywords: characteristic molecular, cytochrome b, Mackerel