Deden Yusman Maulid, Deden Yusman
1Departemen Teknologi Hasil Perairan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor, Institut Pertanian Bogor, Kampus IPB Darmaga, Jalan Agatis, Bogor 16680, Jawa Barat Telepon (0251) 8622915, Faks (0251) 8622916

Published : 2 Documents
Articles

Found 2 Documents
Search

DNA Barcoding untuk Autentikasi Produk Ikan Tenggiri (Scomberomorus sp)

Jurnal Akuatika Vol 6, No 2 (2015): Jurnal Akuatika Vol. VI. No. 2/September 2015
Publisher : Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan

Show Abstract | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (222.836 KB)

Abstract

Abstrak Kebutuhan produk perikanan terus meningkat seiring dengan pertambahan populasi manusia. Keterbatasan bahan baku menyebabkan meningkatnya biaya produksi dan berpotensi menimbulkan kecurangan perdagangan untuk meningkatkan keuntungan sepihak. Ikan Tenggiri (Scomberomorus sp) merupakan ikan perenang cepat dan sering digunakan sebagai bahan baku dalam pembuatan produk perikanan. Proses Pengolahan menyebabkan ikan ini sulit dikenali secara morfologi. Pendekatan molekuler melalui amplifikasi DNA menjadi jalan keluar untuk mengetahui keaslian produk yang telah mengalami perubahan bentuk. Sampel yang telah dikumpulkan terdiri dari baso (Sio), empek-empek (PLm), kerupuk pasar tradisional (KrPsa), dan kerupuk pasar modern (KrLM). dan. Produk tersebut berlabel ikan Tenggiri. Primer yang didesain adalah Cytochrome b dengan target 380bp, merupakan salah satu gene penyandi pada DNA mitokondria. Analisis kesejajaran digunakan untuk mengetahui kedekatan kekerabatan species. Berdasarkan hasil penelitian ini, tiga produk yaitu baso, kerupuk dari pasar modern (KrLM), dan empek-empek diketahui menggunakan bahan baku ikan tenggiri, akan tetapi kerupuk yang diperoleh dari pasar tradisional (KrPsa) tidak terlacak menggunakan bahan baku ikan tenggiri. Kata kunci : Autentikasi, Primer, Tenggiri

Molecular Characteristics of Cytochrome B for Mackerel Barcoding

Jurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia Vol 19, No 1 (2016): Jurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia
Publisher : Department of Aquatic Product Technology

Show Abstract | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (1957.716 KB)

Abstract

Cytochrome b (cyt b) is one of the genes in mitochondrial DNA that is often used as a molecularmarker to identify species through DNA Barcoding. The aim of the present study was to investigate thebioinformatic of cyt b that isolated from mackerel fish. PCR amplification showed the length of DNA cytb from king mackerel was 803 bp within purine 312 bp and pyrimidine 491 bp while Korean mackerel 791bp within purine 316 bp and pyrimidine 475 bp. Phylogenetic analysis showed all sample join in mackerelgroups (Scomberomorus commerson and Scomberomorus koreanus). The Isoelectric point value of cyt b fromking mackerel is 6.38 and molecular weight is 29826.23; Korean mackerel are 8.67 and molecular weight is29372.77. Hydrophaty plot showed cyt b of mackerel more hydrophobic. Based on 3D modelling both ofthem have eight different sections showing by different colors.Keywords: characteristic molecular, cytochrome b, Mackerel