Anika, Mutia
Pusat Kajian Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Fakultas MIPA Universitas Negeri Padang

Published : 1 Documents
Articles

Found 1 Documents
Search

Bioinformatics Study Genes Encoding Enzymes Involved in the Biosynthesis of Carotenoids Line Cassava (Manihot esculenta)

EKSAKTA: Berkala Ilmiah Bidang MIPA Vol 20 No 1 (2019): EKSAKTA : Berkala Ilmiah Bidang MIPA
Publisher : Pusat Kajian Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Fakultas MIPA Universitas Negeri Padang

Show Abstract | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Singkong (Manihot esculenta) adalah salah satu tanaman pangan yang mengandung karbohidrat tinggi dan digunakan sebagai bahan baku berbagai industri. Singkong juga mengandung beberapa jenis protein, termasuk beta-karoten. Namun, beberapa tanaman juga mengandung berbagai tingkat beta-karoten. Beta-karoten adalah salah satu kelompok karoten yang berfungsi sebagai prekursor vitamin A. Penelitian bioinformatika ini bertujuan untuk menentukan persamaan dan perbedaan dalam gen penyandi enzim yang terlibat dalam jalur biosintesis karotenoid dalam singkong dengan beberapa tanaman yang mengandung beta-karoten dari sekuens nukleotida dan pengkodean protein gen karotenoid (Lcy α dan Lcy β). Data tentang urutan nukleotida dan protein diperoleh melalui database NCBI. Kesamaan dan perbedaan dalam data nukleotida dan urutan protein terlihat dari pohon filogenetik menggunakan program MEGA 7.0. Berdasarkan gen nukleotida, Lcy α Manihot esculenta dengan beberapa tanaman yang mengandung beta-karoten tidak berhubungan. Berdasarkan urutan protein nukleotida pohon filogenetik Lcy α dan Lcy β Manihot esculenta dengan beberapa tanaman yang mengandung beta-karoten ada perbedaan